La deuxième année des études pharmaceutiques à Angers

Tordons le cou tout de suite aux idées reçues : ce n’est pas une année sabbatique !
Les TP et le Projet prennent du temps. Les cours du 2nd semestre, en particulier, démarrent en fanfare avec 4 cours /j, 3j /semaine. Beaucoup s’y trompent (15 pers. / 77 au rattrapage en 2009, soit près de 20%). Il reste quand même les fameuses demi-journées de libre, généralement au moins une / semaine. On commence le matin à 8h ou 8h30, et on ne finit pas après 17h15 (normalement). Certains TP sont parfois longs surtout au début de l’année.

Sommaire

• Les matières
  • 1er semestre « Sciences fondamentales »
    • Programmes
• 2nd semestre « Sciences appliquées »
  • • Programmes
• Les examens
• Validation
• Les examens de TP intégrés
• Le projet d’études : « une étude bibliographique sur un sujet de santé publique »
• Les stages

Les matières

1er semestre « Sciences fondamentales »

-  Chimie ana
-  Chimie Orga
-  Dossier mêlant les 2
-  Chimie Miné
-  Biochimie
-  Physio du Système nerveux
-  Pharmacie galénique
-  Communication avec les militaires de l’Ecole du Génie
-  TP gestes de base en chimie et TP d’application : biochimie, chimie ana /orga, galénique/chimie ana, chimie gé.

Programmes

Chimie analytique

But = comprendre et pouvoir utiliser un protocole Pharmacopée. Les exercices et sujets sont essentiellement basés sur des extraits de la Pharmacopée.

Partie 1 : Titrages volumétriques
-   Réaction Acide/ base : interaction solvant/soluté, réactions AB dans les solvants inertes, dans les solvants protoactifs peu dissociants, dans les solvants protiques dissociants
-   Titrage AB : principe, dosage en milieu aqueux, en milieu non aqueux,
-   Titrage Oxydoréduction : principe, méthodes iodométriques, autres méthodes.
-   Titrage Complexométrie : principe, dosage du sulfate de zinc, applications
-   Titrage Précipitation : principe, méthode de Charpentier-Volhard, application

Partie 2 : Méthodes de séparation
-   Généralités
-   Extraction : généralités sur l’extraction liquide/liquide, applications, extraction solide/liquide
-   Chromatographie : généralités, chromato planaire (CCM), chromato liquide, analyse qualitative et quantitative (étalonnage interne et externe), chromato gazeuse.

Chimie organique

Poursuite de l’étude des fonctions organique entamée en première année, selon un plan constant : Généralités/ propriétés physiques/propriétés chimiques/obtention/intérêt.

-   Dérivés halogénés
-   Alcanes
-   Alcènes
-   Alcynes
-   Arènes
-   Phénols
-   Dérivés soufrés
-   Amides
-   Dérivés nitrés
-   Azotures
-   Les Amino-acides
-   Réaction de Maillard
-   Hétérocycles aromatiques
-   Hétérocycles saturés

Dossier CA/CO
3ED d’exercices combinant ces deux matières (extraits Pharmacopée).

Chimie minérale

-   Silicium et dérivés
-   Les métaux de transition
-   Les métaux du bloc p
-   Métaux et biologie
-   Métaux et thérapeutique
-   Les gaz médicaux

Biochimie

-   Métabolisme des acides aminés

• Généralités
• Destin des acides aminés

-   Les protéines :

• Généralités
• Structure des protéines
• Acquisition de la structure spatiale
• Fonctionnalité des protéines ou interaction protéines ligands
• Interaction enzyme substrats

-   Les glucides

• Généralités
• Les osides

-   Métabolisme des glucides

• Place des glucides dans le métabolisme cellulaire
• Digestion
• Flux : quelles destinées pour le glucose dans les cellules : Glycogénogénèse, Voie des pentoses, Glucogénèse
  Glycogénolyse, Néoglucogénèse .

Physiologie

-   Structure et physiologie du système nerveux
-   La transmission synaptique
-   Anatomie et physiologie du système nerveux :

• Les méninges et le LCR
• La moelle spinale
• Le tronc cérébral
• Le cervelet
• Les formations diencéphaliques
• Le télencéphale

-   Système nerveux végétatif
-   Vascularisation du système nerveux

Pharmacie galénique

Etude des différentes formes galéniques : composition, modalités de libération du P.A, utilisation, contrôles à pratiquer au cours de la formulation et après.
-   Les mélanges de poudre
-   Les comprimés
-   Les capsules
-   L’enrobage et la microencapsulation
-   Les formes à libération modifiée
-   Les émulsions
-   Les formes galéniques des voies aériennes

Communication

Après quelques notions théoriques, il faudra mettre en application devant la caméra. Pas d’inquiétude, tout se passe bien, et en petit comité. Un bon entraînement pour l’oral de projet !

2nd semestre « Sciences appliquées »

-  Module Cœur-Rein-Poumon
-  Parasitologie/mycologie médicale
-  Immunologie
-  Mycologie
-  Biologie moléculaire / Gènes impliqués dans les cancers
-  Bactériologie/virologie
-  Pharmacologie : moléculaire et générale (2 profs, deux épreuves couplées)
-  Pharmacocinétique
-  TP gestes de bases en biologie évalués sous forme de contrôle continu (petites notes au fil des TP) et TP d’application évalués en même temps que les TP d’application du 1er semestre (TP intégrés) voir plus loin.

Programmes

Module CRP

Trois intervenants pour cette matière.

Physiologie

-   Le système cardiovasculaire

• Le cœur
• Les vaisseaux
• La pression artérielle
• Le système lymphatique

-   L’appareil urinaire, le rein

• Anatomie interne, externe
• Physiologie

-   L’appareil respiratoire

• Anatomie
• Physiologie
• Volume respiratoire
• Phénomène physicochimique
• Régulation

Analyses

-   Protéinurie
-   Evaluation fonctionnelle du rein : créatininurie, créatininémie, diurèse…
-   Equilibre hydrominéral et acidobasique

+ Approche physique des échanges respiratoires.

Parasitologie et Mycologie médicale

-   Notions générales en parasitologie, définitions (partie très importante)
-   Les maladies parasitaires
-   Diagnostic des parasitoses
-   Conséquences pratiques déduites de la connaissances de la biologie des parasites
-   Généralités en mycologie
-   Les levures
-   Les dermatophytes
-   Les aspergilloses
-   Les antifongiques
-   Rôle pathogène des arthropodes

Immunologie

-   Généralités : les acteurs de l’immunité, la phagocytose
-   Les anticorps : structure, différents types d’immunoglobulines, rôles
-   Les antigènes : par quels types d’anticorps sont-ils reconnus, que reconnaît l’anticorps ?
-   Gènes d’immunoglobulines et développement des LB : quels évènement génétiques aboutissent à une telle diversité de récepteurs aux antigènes ?
-   Le complexe majeur d’histocompatibilité : caractéristiques, structure, localisation, fonctions
-   Techniques immunologiques : productions de sérums, d’Ac monoclonaux et techniques basées sur la réaction antigène anticorps.
-   Les cytokines : caractéristiques, mode d’action, propriétés
-   Les lymphocytes T : structure du récepteur, maturation et activation des LT
-   Le complément : voies d’activation : classique et alterne, voie commune, régulation, conséquences biologiques de l’activation du complément.
-   La réaction inflammatoire
-   Vaccins

Mycologie

Apprendre à reconnaître les champignons communs dans la région, distinguer les comestibles des toxiques. Examen écrit de validation du cours en septembre de 3ème Année.
-   Les Aphyllophorales : Chanterelles, Pied De Mouton
-   Les Boletales : Bolets, Gomphides, Paxilles
-   Les Russulales : Lactaires et Russules
-   Super-Ordre des Agaricales :
Les Tricholomatales : Tricholomes, Clitocybes, Armillaires, Laccaires, Marasmes
Les Plutéales : Plutées, Volvariella, Entolome
Les Cortinariales : Cortinaires, Hébélome, Inocybe, Gymnopilus
Les Agaricales : Coprins, Agarics, Lépiotes, Amanites

Biologie moléculaire

Outils et applications

Chapitre I : outils et méthodes du génie génétique
-   Modifications enzymatiques de l’ADN

• Les Enzymes De Restriction
• Les Adn Polymérases
• Les Adn Ligases

-   Marquage de l’ADN

• Les Agents De Marquage
• Les Stratégies De Marquage

-   Séquençage de l’ADN

-   Méthodes d’hybridation moléculaire

• Southern blotting
• Northern blotting

-   Vecteurs et banques

• caractéristiques d’un vecteur de clonage
• exemples de vecteurs
• constitution d’une banque d’ADNc
• les banques d’ADN génomique

Chapitre II : Production de protéines recombinantes
-   Complexité du problème

• nature de la cellule hôte
• choix du vecteur d’expression
• obtention d’un produit biologiquement actif
• rendement du système

-   Un exemple concret : synthèse de l’insuline

• chez la bactérie E.coli
• chez la levure Saccharomyces cerevisiæ

Gènes impliqués dans les cancers
-   Cycle cellulaire et points de contrôle
-   Cancers, oncogènes et gènes suppresseurs de tumeurs

Bactériologie / virologie

Partie 1 :
-   Le métabolisme bactérien
-   Évolution du génome bactérien

Partie 2 :
-   Les facteurs de pathogénicité des bactéries

Partie 3 : Virologie
-   Voie de pénétration des agents infectieux
-   La structure des virus
-   Évolution du génome viral

Pharmacologie moléculaire

Chapitre 1 : Généralités
-   définitions, les différents niveaux d’intégration d’une réponse pharmacologique
-   notion d’affinité des médicaments et de sélectivité des médicaments
-   cibles des médicaments : récepteurs, enzymes, canaux.

Chapitre 2 : Canaux, transporteurs et pompes ioniques
-   Généralités
-   Canaux ioniques (Na, Ca, K)
-   Transporteurs ioniques (NKCC, NCC, NHE et NCX)
-   Pompes ioniques (famille des P-ATPases)

Chapitre 3 : les récepteurs des médiateurs
-   Généralités
-   Les récepteurs ionotropes
-   Les récepteurs enzymes
-   Les récepteurs couplés aux protéines G

Pharmacologie générale

L’action des médicaments sur les récepteurs des médiateurs et effet thérapeutique. Il faut connaître les effets de chaque composante, et les médicaments associés.
-   Transmission cholinergique
-   Transmission noradrénergique
-   Transmission dopaminergique
-   Transmission histaminergique
-   Transmission sérotoninergique
-   Transmission opioïdergique
-   Transmission GABAergique
-   Récepteurs au NMDA

Pharmacocinétique

L’étude de l’action de l’organisme sur le médicament (et non l’inverse), basée sur des modèle mathématiques. De grands principes à retenir et surtout à comprendre : Steady state, les compartiments, les graphes en fonction du modèle compartimental et de la voie d’administration (en bolus ou non), les méthodes pour accéder au modèle compartimental (méthode des résidus, des trapèzes).

Les examens

En février : matières du Semestre 1, résultats mi-avril.
En juin : matières du Semestre 2, résultats 10-15 juillet.
Les écrits durent 3 jours, épreuves durent entre 1 et 2h.

Validation

Les matières sont regroupées en UE (unité d’enseignement) cf. poly de rentrée pour le descriptif des UE.
Pour valider l’année, il faut au moins 10 de moyenne générale, c’est-à-dire en faisant la moyenne des moyennes d’UE. Les moyennes d’UE se compensent entre elles, c’est-à-dire qu’une moyenne haute dans une UE permet de faire remontée une moyenne générale abaissée par une moyenne d’une autre UE un peu faiblarde.
Pour être compensée, la moyenne d’UE doit être supérieure à 8/20. Sinon, elle devra être validée à la deuxième session (rattrapage).

Les examens de TP intégrés

Ça fait un peu peur. En fait ce n’est pas si grave ! C’est intense par contre : 3x3h de TP sur un même thème réparties sur 3 jours.
Le sujet (tiré au sort) mêle plusieurs matières (de 2 à 4) du 1er semestre comme du 2nd.
Pas de grosses révisions à faire, juste relire le cahier de TP.

Exemple de TPi : « Dosage de l’activité d’une phosphatase »
Jour 1 : oral individuel
-  proposer un protocole de dosage (vu en TP)
-  proposer un moyen permettant de séparer produit final et de départ lors de la synthèse du PNP (produit permettant le dosage)
-  méthode être sur que le produit est pur
Jour 2 : Chimie Orga : synthèse du PNP
Jour 3 : Biochimie/chimie gé : dosage de l’activité phosphatase par spectro, avec une cinétique (TP déjà effectué dans l’année), calcul de l’énergie d’activation

Le projet d’études : « une étude bibliographique sur un sujet de santé publique »

-  Constituez un groupe de 3 ou 4 mais pas plus, après ça peut être difficile de trouver des compromis.
-  Feuilletez les rapports des années précédentes à la salle de lecture, pour vous donner des idées tout en évitant les redites.
-  Travaillez votre plan le plus tôt possible.
-  Version provisoire rendue 31mars -> corrigée par un prof qui vous rend une feuille avec une note comptant pour la note finale, et des suggestions d’amélioration (à suivre !!)
-  Cette même personne corrigera la version définitive de votre rapport, rendue le 2-3 juin.
-  Pour trouver un référent, faites marcher votre carnet d’adresses. Si vous n’en avez pas, prenez l’annuaire, ou rendez vous directement au CHU (mais ils sont un peu surbookés).

Les stages

Le stage officinal
La fac fournit des documents forts complets sur ce stage, et la réunion qui intervient à la fin de la première semaine de stage répond aux questions qui subsistent.
Quant à l’examen, il est composé d’une épreuve de reconnaissances, plantes et substances chimiques (généralement bien réussie mais il faut s’entraîner), une épreuve de posologies (pas de mystère, il faut les apprendre), et un entretien avec un pharmacien et un professeur de la fac. Souvent, ça fait très peur, car c’est le premier oral du cursus. En fait, il ne faut pas paniquer, et répondre calmement aux questions posées (« Qu’avez-vous fait pendant votre stage ? » principalement, et parfois une petite question pour vérifier qu’on y a appris quelque chose).

Les « mini-stages » découverte

C’est une vraie chance, sachez que ça n’est pas proposé partout.
Prenez contact tôt, et ne signez pas les conventions au dernier moment.
Debriefing en septembre de 3ème année pour partager son expérience avec le groupe.

Le stage SIR ne sera désormais plus proposée en 2e année, mais entrera dans le cadre de l’UV recherche, (UV optionnelle de 3e et 4e année, voir les documents s’y référant).