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Defining Functionally Relevant Spatial Chromatin Domains: It is a TAD Complicated- Natalia Sikorska, Thomas Sexton - février 2020
Par Natalia Sikorska - Mise en ligne le 5 février 2022Mots clefs : Genome organization, gene expression, topologically associated domains (TADs), loop extrusion model, gene expression, CTCF, enhancer,
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ChiCMaxima: a robust and simple pipeline for detection and visualization of chromatin looping in Capture Hi-C- Ben Zouari Y, Molitor AM, Sikorska N, Pancaldi V, Sexton T. - mai 2019
Par Natalia Sikorska - Mise en ligne le 5 février 2022Mots clefs : Promoter-enhancer interactions, Chromatin loops, Capture Hi-C, Biological replicates, Gene regulation, Chromatin assortativity
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Limited ER quality control for GPI-anchored proteins. Sikorska N, Lemus L, Aguilera-Romero A, Manzano-Lopez J, Riezman H, Muñiz M, Goder V. - juin 2016
Par Natalia Sikorska - Mise en ligne le 5 février 2022Mots clefs : Protein maturation, Endoplasmic reticulum (ER), ER-associated degradation (ERAD), glycophosphatidylinositol-anchored proteins (GPI-APs)
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High-Resolution Mapping of 3’ Extremities of RNA Exosome Substrates by 3’ RACE-Seq Scheer H, De Almeida C, Sikorska N, Koechler S, Gagliardi D, Zuber H. - décembre 1999
Par Natalia Sikorska - Mise en ligne le 5 février 2022Mots clefs : 3′ Adapter ligation; 3′ RACE-seq; Exosome; Illumina sequencing; MiSeq; Rapid amplification of cDNA 3′ end; Untemplated nucleotides; rRNA maturation
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