Disciplines notamment concernées
Sections médicales : Biochimie et biologie moléculaire (44-01), Physiologie (44-02), Biologie cellulaire (44-03), Biophysique et médecine nucléaire (43-01), Nutrition (44-04), Génétique (47-04)
Sections pharmaceutiques : Biophysique - Biomathématiques (85), Chimie organique (86), Chimie générale et minérale, chimie physique (85), Physiologie (86), Biochimie générale et clinique - biologie moléculaire (87)
Sections scientifiques : Chimie théorique(31), Chimie organique (32), Biochimie et biologie moléculaire (64)
Objectifs Généraux
- Acquérir les connaissances de base sur les atomes et sur l’organisation des molécules du vivant
- Savoir décrire les principales fonctions chimiques utiles à la vie et à la
compréhension de l’action des médicaments, à la compréhension de principales dysfonctions métaboliques (exemple de maladies), à la compréhension des dysfonctions liées à l’environnement. - connaître les principales molécules biologiques (relation structure - fonction) et savoir décrire les principales fonctions utiles à la compréhension du maintien d’équilibres biologiques (physiologie) ou à la compréhension des déséquilibres (exemple de maladies) - connaître les bases moléculaires de l’organisation du génome - appréhender les étapes essentielles de la fonction du génome, de l’expression des gènes - connaître le rôle principal des bio nutriments et le métabolisme énergétique.
Principaux items
L’atome :
- Classification périodique des éléments
- Représentation et configuration électronique
- Structure du noyau atomique
- Liaisons entre atomes et notions d’isomérie :
Liaisons et orbitales moléculaires
Liaisons non covalentes
Liaisons covalentes
Effets inductifs, résonance et mésomérie
Stéréochimie
Thermodynamique : équilibre de dissociation (deuxième principe, enthalpie, potentiel chimique)
Description des fonctions chimiques simples :
- Chaînes hydrocarbonées
- Fonctions hydroxyles et dérivés
- Fonctions amines et dérivés
- Fonctions aldéhydes ou cétones
- Fonctions acides carboxyliques et dérivés
Principales réactions entre fonctions chimiques en biologie :
- Réactions acide- base
- Réactions d’oxydoréduction
- Description des principaux mécanismes réactionnels : substitution, addition, élimination
- Exemples de réactions de fonctions chimiques des molécules biologiques :
alcools, amines, thiols, aldéhydes et cétones, carboxyles.
Structure, diversité et fonction des biomolécules
- Acides aminés et dérivés : Structure et propriétés des AA - Propriétés et rôle biologique des dérivés d’acides aminés - Méthodes d’étude
- Peptides et protéines : Structure primaire et liaison peptidique - Structures secondaires, tertiaire et quaternaire des protéines - Propriétés et méthodes d’étude des protéines - Relation structure-fonction
- Enzymes : Pouvoir catalytique et cinétique des enzymes - Régulation de
l’activité des enzymes - Les iso enzymes et leur intérêt en biologie - Mesure de l’activité des enzymes -Coenzymes et vitamines
- Glucides : Oses simples ou monosaccharides - Oses complexes ou
polysaccharides - Glycoprotéines et glycolipides - Un exemple de voie
métabolique des oses : la glycolyse
- Lipides : Acides gras et dérivés : structure, rôle biologique - Glycérides -
Sterols et Steroides - Lipoprotéines et rôle biologique
Organisation, évolution et fonction du génome humain
- Structure et métabolisme des nucleotides - structure des acides nucléiques - chromatine et ADN - replication de l’ADN et mécanismes de réparation - mutabilité et dynamique de l’ADN
- Structure et diversité du génome (allele et polymorphisme) - Lésions et
remaniements du génome - Transcription et maturation des ARNm - Régulation de l’expression des gènes -code génétique et traduction
Bioénergétigue : Énergétique cellulaire et notions de bioénergétique - Fonction biochimique et rôle des nucleotides riches en énergie
Vue d’ensemble du métabolisme : Programme d’enseignement à coordonner avec celui des UE de L2-L3
Principales voies et stratégies du métabolisme énergétique, les oxydations
phosphorylantes et le cycle de Krebs, digestion des glucides et glycolyse -
Néoglucogenèse et métabolisme du glycogène, digestion et transport des
lipides ßoxydation des acides gras, biosynthèse des acides gras et cétogénèse, métabolisme général des acides aminés et cycle de l’urée